رهبر انقلاب اسلامی، آیتالله خامنهای، در دیدار دستاندرکاران گردهمایی بزرگداشت آیتالله نائینی، تربیت شاگرد را یکی از خصوصیات مهم این عالم برجسته دانستند و تاکید کردند که مراجع
رهبر معظم انقلاب اسلامی در گردهمایی بزرگداشت آیتالله نائینی، بر دو اصل کلیدی در اندیشه این فقیه تأکید کردند: ضرورت تشکیل حکومت اسلامی و جایگاه محوری مفهوم ولایت
رهبر انقلاب اسلامی، تعبیر امروزی «جمهوری اسلامی» را معادل حکومت مردمی و دینی مورد نظر آیتالله میرزا محمدحسین نائینی دانستند و بر سه اصل قدرت، انتخاب مردمی و
رهبر انقلاب در دیدار دستاندرکاران گردهمایی بزرگداشت آیتالله میرزای نائینی، نوآوریهای ایشان در مبانی اصول فقه را فوقالعاده و درخور بحث علمی دانستند.